شهر سه قلعه  در شمال غربی استان بر پهنه ی  دشت وسیعی واقع شده ، که این دشت از کوهپایه های غربی ارتفاعات شمالی استان  با شیبی ملایم  به سمت نواحی کویری وگرم وخشک مرکز کشور امتداد دارد  . این شهر که مرکز بخش سه قلعه می باشد درطول جغرافیایی58درجه و 23دقیقه ی شرقی و عرض جغرافیایی 33درجه و 40دقیقه ی شمالی واقع گردیده و از سطح دریا به طور متوسط  1304 متر بلندتر است.

نزدیکترین نقطه ی شهری به آن سرایان در فاصله ی 24کیلومتری و با مرکز استان شهر بیرجند از مسیر سرایان 185 کیلومتر و از مسیر در حال احداث چاه طالب حدود120 کیلومتر فاصله دارد . همچنین فاصله ی این شهر تا مرکز کشور از مسیر بردسکن ، سبزوار ، شاهرود 990 کیلومتر است  .